Государственным комитетом по охране окружающей среды Мурманской области учтено 26 предприятий сельского хозяйства. В основном, эти предприятия имеют смешанное направление, в каждом из которых сосредоточены подразделения крупного рогатого скота, птицеводство, свиноводство, а в некоторых (зверосовхоз "Кольский" и совхозы "Мурманск", "Тулома") и звероводство. Одно из крупных предприятий сельского хозяйства совхоз "Пригородный" специализируется только на свиноводстве (проектная мощность 48 тысяч голов), а 2 птицефабрики "Мурманская" и "Снежная" имеют только птицеводческое направление. В настоящее время в хозяйствах области имеется 25 жижесборников, 15 навозопометохранилищ, 23 площадки для компостирования навоза и помета, 9 сооружений биологической очистки.

Как показали проверки, многие природоохранные сооружения содержатся в неудовлетворительном состоянии. Очистные сооружения биологической очистки в совхозах "Полярная Звезда", "Пригородный" перегружены, не обеспечивают проектную очистку сточных вод, требуют проведения реконструкции и расширения. В совхозе "Ена" очистные сооружения, введенные в 1987 году, из-за строительных недоделок не работают до настоящего времени и требуют полной реконструкции.

Однако, из-за сложного экономического положения хозяйств, строительство и реконструкция природоохранных объектов в 1998 г. не велись.

Наибольшую опасность для окружающей среды представляет навоз и птичий помет, суммарный ежегодный объем этих высокотоксичных отходов составляет порядка 900 тысяч тонн. Наибольшая их часть (свыше 600 тыс. т. в год), преимущественно жидких фракций, вывозится в складки местности. Навоз в объеме около 300 тыс. т. в необработанном виде вносится на поля. В связи с удорожанием работ по приготовлению торфокомпостов, выработка их с 1992 резко сократилось. Проблема использования навоза усугубляется тем, что в регионе крайне мало посевных полей, требующих внесения органических удобрений.

Пестициды в сельском хозяйстве применяются, в основном, для обработки растений в тепличных хозяйствах и незначительно - в открытом грунте.

Для хранения пестицидов в области имеется 4 типовых и 10 приспособленных складов общей емкостью 289,1 т. Нарушений по хранению и применению пестицидов в 1998 г. не выявлено.